三大核酸序列数据库包括 ______、 ______和 ______。

题目

三大核酸序列数据库包括 ______、 ______和 ______。


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  • 第1题:

    关于PDB数据库,正确的是

    A、是全世界最主要的大分子一级结构数据库

    B、其蛋白质结构数目与SwissProt/TrEMBL数据库中的序列数目相当

    C、包括蛋白质、核酸、蛋白质-核酸复合物等生物大分子的三维结构数据库

    D、由NCBI和EBI共同管理

    E、由DDBJ进行日常维护


    参考答案:C

  • 第2题:

    几个重要的核酸序列数据库除外()。

    A、NCBI数据库

    B、DDBJ数据库

    C、EMBL数据库

    D、MIPS数据库


    答案:D

  • 第3题:

    下列不属于国际核酸序列数据库协作体的是()。

    • A、GenBank
    • B、EMBL
    • C、PIR
    • D、DDBJ

    正确答案:C

  • 第4题:

    BLAST程序家族包括5个主要的程序,基于所查询内容和检索的数据库不同而设计,分别为blastn、blastp、blastx、tblastn、tblastx,应区别各自的使用功能。将一个核酸查询序列的6种框架的翻译结果与一个核酸序列数据库的6种框架的翻译产物进行比较的是()

    • A、blastn
    • B、blastp
    • C、blastx
    • D、tblastn
    • E、tblastx

    正确答案:E

  • 第5题:

    蛋白质测序仪主要检测()。

    • A、核苷酸序列
    • B、核糖核酸序列
    • C、碱基序列
    • D、氨基酸序列
    • E、脱氧核糖核酸序列

    正确答案:D

  • 第6题:

    单选题
    BLAST程序家族包括5个主要的程序,基于所查询内容和检索的数据库不同而设计,分别为blastn、blastp、blastx、tblastn、tblastx,应区别各自的使用功能。将一个核酸的查询序列按所有可能的阅读框翻译后的序列与一个蛋白质序列数据库进行比较的是()
    A

    blastn

    B

    blastp

    C

    blastx

    D

    tblastn

    E

    tblastx


    正确答案: E
    解析: 暂无解析

  • 第7题:

    单选题
    PIR和PSD数据库是( )
    A

    世界上最大的蛋白质序列数据库

    B

    中国最大的蛋白质序列数据库

    C

    欧洲最大的蛋白质序列数据库

    D

    美国最大的蛋白质序列数据库

    E

    日本最大的蛋白质序列数据库


    正确答案: D
    解析: 暂无解析

  • 第8题:

    单选题
    BLAST程序家族包括5个主要的程序,基于所查询内容和检索的数据库不同而设计,分别为blastn、blastp、blastx、tblastn、tblastx,应区别各自的使用功能。将一个核酸查询序列与一个核酸序列数据库进行比较的是()
    A

    blastn

    B

    blastp

    C

    blastx

    D

    tblastn

    E

    tblastx


    正确答案: E
    解析: 暂无解析

  • 第9题:

    单选题
    PDB数据库()。
    A

    是全世界最主要的大分子三级结构数据库

    B

    其蛋白质结构数目与SwissProt/TrEMBL数据库中的序列数目相当

    C

    包括了蛋白质、核酸、蛋白质/核酸复合物等结构数据

    D

    由NCBI和EBI共同管理和维护


    正确答案: B
    解析: 暂无解析

  • 第10题:

    单选题
    BLAST程序家族包括5个主要的程序,基于所查询内容和检索的数据库不同而设计,分别为blastn、blastp、blastx、tblastn、tblastx,应区别各自的使用功能。将一个核酸查询序列的6种框架的翻译结果与一个核酸序列数据库的6种框架的翻译产物进行比较的是()
    A

    blastn

    B

    blastp

    C

    blastx

    D

    tblastn

    E

    tblastx


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第11题:

    单选题
    BLAST程序家族包括5个主要的程序,基于所查询内容和检索的数据库不同而设计,分别为blastn、blastp、blastx、tblastn、tblastx,应区别各自的使用功能。将一个蛋白质查询序列与一个以所有阅读框动态翻译成蛋白质的核酸序列数据库相比较的是()
    A

    blastn

    B

    blastp

    C

    blastx

    D

    tblastn

    E

    tblastx


    正确答案: A
    解析: 暂无解析

  • 第12题:

    多选题
    ()是现在国际上最主要的三大核酸序列数据库
    A

    EMBL

    B

    DDBJ

    C

    GenBank

    D

    NCBI

    E

    EBI


    正确答案: E,A
    解析: 暂无解析

  • 第13题:

    核酸探针的标志性特征是()。

    A、一小段已知序列的单链核酸

    B、一小段未知序列的单链核酸

    C、一小段已知序列的双链核酸

    D、有同位素或非同位素标记物


    答案:D

  • 第14题:

    下列哪项是属于事实与数值数据库?()

    • A、Ovid电子图书
    • B、核酸序列数据库GenBank
    • C、WebofScience
    • D、中国生物医学文献数据库

    正确答案:B

  • 第15题:

    EBI开发的生物学数据库不包括()

    • A、核酸序列数据库
    • B、全部基因组数据库
    • C、蛋白质序列数据库
    • D、序列结构分类数据库
    • E、Swiss-3DImage数据库

    正确答案:E

  • 第16题:

    概述核酸序列测定的方法和应用领域。


    正确答案: D.NA的序列测定目前多采用Sanger提出的链终止法,和Gilbert提出的化学法。其中链终止法经不断改进,使用日益广泛。链终止法测序的技术基础主要有:
    ①用凝胶电泳分离DNA单链片段时,小片段移动,大片段移动慢,用适当的方法可分离分子大小仅差一个核苷酸的DNA片段。
    ②用合适的聚合酶可以在试管内合成单链DNA模板的互补链。反应体系中除单链模板外,还应包括合适的引物,4种脱氧核苷三磷酸和若干种适量的无机离子。如果在4个试管中分别进行合成反应,每个试管的反应体系能在一种核苷酸处随机中断链的合成,就可以得到4套分子大小不等的片段,如新合成的片段序列为-CCATCGTTGA-,在A处随机中断链的合成,可得到-CCA和-CCATCGTA两种片段,在G处中断合成可得到-CCATCG和-CCATCGTTG两种片段。在C和T处中断又可以得到相应的2套片段。用同位素或荧光物质标记这4套新合成的链,在凝胶中置于4个泳道中电泳,检测这4套片段的位置,即可直接读出核苷酸的序列。在特定碱基处中断新链合成最有效的办法,是在上述4个试管中按一定比例分别加入一种相应的2,3-双脱氧核苷三磷酸(ddNTP),由于ddNTP的3位无-OH,不可能形成磷酸二酯键,故合成自然中断。如上述在A处中断的试管内,既有dATP,又有少量的ddATP,新合成的-CCA链中的A如果是ddAMP,则链的合成中断,如果是dAMP,则链仍可延伸。因此,链中有几个A,就能得到几种大小不等的以A为末端的片段。如果用放射性同位素标记新合成的链,则4个试管中新合成的链在凝胶的4个泳道电泳后,经放射自显影可检测带子的位置,由带子的位置可以直接读出核苷酸的序列。采用T7测序酶时,一次可读出400多个核苷酸的序列。近年采用4种射波长不同的荧光物质分别标记4种不同的双脱氧核苷酸,终止反应后4管反应物可在同一泳道电泳,用激光扫描收集电泳信号,经计算机处理可将序列直接打印出来。采用毛细管电泳法测序时,这种技术一次可测定700个左右核苷酸的序列,一台仪器可以有几十根毛细管同时进行测序,且电泳时间大大缩短,自动测序技术的进步加快了核酸测序的步伐,现已完成了包括人类在内的几十个物种的基因组测序。
    R.NA序列测定最早采用的是类似蛋白质序列测定的片段重叠法,Holley用此法测定酵母丙氨酸tRNA序列耗时达数年之久。随后发展了与DNA测序类似的直读法,但仍不如DNA测序容易,因此,常将RNA反转录成互补DNA(cDNA),测定cDNA序列后推断RNA的序列,目前16SrRNA1542b的全序列测定,23SrRNA2904b的全序列测定,噬菌体MS2RNA3569b的全序列测定均已完成。

  • 第17题:

    问答题
    概述核酸序列测定的方法和应用领域。

    正确答案: D.NA的序列测定目前多采用Sanger提出的链终止法,和Gilbert提出的化学法。其中链终止法经不断改进,使用日益广泛。链终止法测序的技术基础主要有:
    ①用凝胶电泳分离DNA单链片段时,小片段移动,大片段移动慢,用适当的方法可分离分子大小仅差一个核苷酸的DNA片段。
    ②用合适的聚合酶可以在试管内合成单链DNA模板的互补链。反应体系中除单链模板外,还应包括合适的引物,4种脱氧核苷三磷酸和若干种适量的无机离子。如果在4个试管中分别进行合成反应,每个试管的反应体系能在一种核苷酸处随机中断链的合成,就可以得到4套分子大小不等的片段,如新合成的片段序列为-CCATCGTTGA-,在A处随机中断链的合成,可得到-CCA和-CCATCGTA两种片段,在G处中断合成可得到-CCATCG和-CCATCGTTG两种片段。在C和T处中断又可以得到相应的2套片段。用同位素或荧光物质标记这4套新合成的链,在凝胶中置于4个泳道中电泳,检测这4套片段的位置,即可直接读出核苷酸的序列。在特定碱基处中断新链合成最有效的办法,是在上述4个试管中按一定比例分别加入一种相应的2,3-双脱氧核苷三磷酸(ddNTP),由于ddNTP的3位无-OH,不可能形成磷酸二酯键,故合成自然中断。如上述在A处中断的试管内,既有dATP,又有少量的ddATP,新合成的-CCA链中的A如果是ddAMP,则链的合成中断,如果是dAMP,则链仍可延伸。因此,链中有几个A,就能得到几种大小不等的以A为末端的片段。如果用放射性同位素标记新合成的链,则4个试管中新合成的链在凝胶的4个泳道电泳后,经放射自显影可检测带子的位置,由带子的位置可以直接读出核苷酸的序列。采用T7测序酶时,一次可读出400多个核苷酸的序列。近年采用4种射波长不同的荧光物质分别标记4种不同的双脱氧核苷酸,终止反应后4管反应物可在同一泳道电泳,用激光扫描收集电泳信号,经计算机处理可将序列直接打印出来。采用毛细管电泳法测序时,这种技术一次可测定700个左右核苷酸的序列,一台仪器可以有几十根毛细管同时进行测序,且电泳时间大大缩短,自动测序技术的进步加快了核酸测序的步伐,现已完成了包括人类在内的几十个物种的基因组测序。
    R.NA序列测定最早采用的是类似蛋白质序列测定的片段重叠法,Holley用此法测定酵母丙氨酸tRNA序列耗时达数年之久。随后发展了与DNA测序类似的直读法,但仍不如DNA测序容易,因此,常将RNA反转录成互补DNA(cDNA),测定cDNA序列后推断RNA的序列,目前16SrRNA1542b的全序列测定,23SrRNA2904b的全序列测定,噬菌体MS2RNA3569b的全序列测定均已完成。
    解析: 暂无解析

  • 第18题:

    单选题
    蛋白质测序仪主要检测()。
    A

    核苷酸序列

    B

    核糖核酸序列

    C

    碱基序列

    D

    氨基酸序列

    E

    脱氧核糖核酸序列


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第19题:

    填空题
    初级序列数据库();()和()

    正确答案: GenBank,EMBL,DDBJ
    解析: 暂无解析

  • 第20题:

    单选题
    将核酸序列按照6条链翻译成蛋白质序列后搜索蛋白质序列数据库使用的程序是()。
    A

    blastp

    B

    blastx

    C

    tblastn

    D

    tblastx


    正确答案: D
    解析: 暂无解析

  • 第21题:

    单选题
    下列哪项是属于事实与数值数据库?()
    A

    Ovid电子图书

    B

    核酸序列数据库GenBank

    C

    WebofScience

    D

    中国生物医学文献数据库


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第22题:

    问答题
    国际上权威的核酸序列数据库有哪些?

    正确答案: (1)欧洲分子生物学实验室的EMBL。
    (2)美国生物技术信息中心的GenBank。
    (3)日本遗传研究所的DDBJ。
    解析: 暂无解析

  • 第23题:

    单选题
    下列不属于国际核酸序列数据库协作体的是()。
    A

    GenBank

    B

    EMBL

    C

    PIR

    D

    DDBJ


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第24题:

    单选题
    关于PDB数据库,正确的是()
    A

    是全世界最主要的大分子一级结构数据库

    B

    其蛋白质结构数目与SwissProt/TrEMBL数据库中的序列数目相当

    C

    包括蛋白质、核酸、蛋白质-核酸复合物等生物大分子的三维结构数据库

    D

    由NCBI和EBI共同管理

    E

    由DDBJ进行日常维护


    正确答案: C
    解析: 暂无解析